अद्यतन कुछ खिलाड़ियों के लिए गेम-ब्रेकिंग मुद्दों के कारण हुआ। पहले के कालकोठरी में एक मुख्य खोज सॉफ्टलॉक ने कई उपयोगकर्ताओं के लिए प्रगति को रोका। अन्य लोगों ने फोटो मोड के सेल्फी कैमरे का उपयोग करते हुए क्रैश का अनुभव किया, और नए कॉस्मेटिक आइटम ईव पर सही ढंग से रेंडर करने में विफल रहे।
] वे खिलाड़ियों को सलाह देते हैं कि वे क्वेस्ट प्रगति से बचें और स्थायी सॉफ्टलॉक को रोकने के लिए पैच की प्रतीक्षा करें।]
Nier: ऑटोमेटा सहयोग पैच 1.009 की एक प्रमुख विशेषता है। डेवलपर्स ने नीयर: ऑटोमेटा से खींची गई महत्वपूर्ण प्रेरणा पर प्रकाश डाला, निर्देशक किम ह्युंग ताए और निर्देशक योको तारो के बीच सहयोगी भावना पर जोर देते हुए। ग्यारह अनन्य सहयोग आइटम एमिल के माध्यम से उपलब्ध हैं, एक नीर चरित्र अब तारकीय ब्लेड की दुनिया में रहता है।
] नई फोटो चुनौतियां इस सुविधा को और बढ़ाती हैं।ईव के लिए नए संगठन और एक नया गौण (एक विशिष्ट अंत के बाद अनलॉक किया गया) को टैची मोड को संशोधित करने के लिए जोड़ा गया है। एक "नो पोनीटेल" विकल्प अतिरिक्त चरित्र अनुकूलन प्रदान करता है। आगे के सुधारों में छह अतिरिक्त भाषाओं के लिए लिप-सिंक, इंस्टेंट डेथ स्किल के लिए प्रोजेक्टाइल ऑटो-एआईएम और बुलेट चुंबक कार्यक्षमता और विभिन्न मामूली बग फिक्स शामिल हैं।